Beim australischen Great Barrier Reef geht es hoch her. Hier in der bunten und aufregenden Unterwasserwelt lebt der kleine Clownfisch Nemo, der ausgerechnet an seinem ersten Schultag von Tauchern "entführt" wird und fortan in einem Aquarium in einer Zahnarztpraxis in Sydney sein Leben in Gesellschaft etwas sehr seltsamer Tropenfische fristen soll. Nemos Vater begibt sich währenddessen auf eine abenteuerliche Suche nach seinem Sohn Nemo.